目前，市面上常见的咖啡豆主要有阿拉比卡（Arabica）、罗布斯塔（Robusta）和利比里卡（Liberica）三大品种 ，每一个品种都有着独特的风味特点。
阿拉比卡种咖啡豆占据了全世界咖啡生产量的70%左右，它多被种植于山区、高原等地带。由于生长环境的特殊性，阿拉比卡咖啡豆的香味更为浓郁复杂，带有优质的酸性，口感细腻柔和，是制作精品咖啡的首选。著名的蓝山咖啡、哥伦比亚咖啡、埃塞俄比亚咖啡等都属于阿拉比卡种。
罗布斯塔种咖啡豆最先于刚果被发现，它是平原地带植物，较阿拉比卡种更耐高温耐热。罗布斯塔咖啡豆苦味强、质感好，并且价格相对低廉，因此多用于灌装咖啡和速溶咖啡。不过，近年来也有一些咖啡师开始尝试将罗布斯塔咖啡豆与阿拉比卡咖啡豆混合，以创造出独特的风味。
利比里卡种咖啡豆原产于非洲西部，虽然对环境有着极强的适应能力，但由于其风味较阿拉比卡种差，且对叶锈病抵抗较弱，所以栽种范围相对较小，仅在西非部分国家国内交易买卖，或者用于研究使用。
除了品种的差异，咖啡豆的产地也对其风味有着至关重要的影响。咖啡树只能种植于以赤道为中心的南北回归线之间，也就是人们常说的“咖啡带”。在这条咖啡带上，分布着众多著名的咖啡产地，如巴西的圣保罗、哥伦比亚的安第斯山脉、越南的中部高地、印度尼西亚的苏门答腊岛等。不同产地的咖啡豆，由于气候、土壤、海拔等自然条件的不同，呈现出各自独特的风味。例如，巴西咖啡口感香醇、中性，适合与其他咖啡豆混合制作综合咖啡；哥伦比亚咖啡具有独特的香味，苦中带有甘味，令人回味无穷；埃塞俄比亚咖啡则带有浓郁的水果香气和花香，酸度明亮，口感清新。